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JULIO LENIN DOMÍNGUEZ  RAMÍREZJULIO LENIN DOMÍNGUEZ  RAMÍREZ
JULIO LENIN DOMÍNGUEZ RAMÍREZ

Grados Académicos:

Doctorado en Ciencias Bioquímicas, Universidad Nacional Autonoma de Mexico.
Licenciado en Investigación Biomédica Básica, Universidad Nacional Autonoma de Mexico.


MIEMBRO DEL SISTEMA NACIONAL DE INVESTIGADORES (SNI) Nivel 2

Doctor en Ciencias Bioquímicas y Licenciado en Investigación Biomédica Básica por la Universidad Nacional Autónoma de México. Comienza a interesarse en las ciencias inspirado por el Premio Nobel de Química de 1997, otorgado a: Paul D. Boyer, John E. Walker y Jens C. Skou. Motivado por el trabajo de los personajes anteriores, decide dar una visión estructural a sus proyectos, trabajando con los doctores Armando y Marietta Tuena de Gómez Puyou en la licenciatura y en el Instituto de Fisiología Celular de la UNAM mientras cursaba el Doctorado.
Durante su trayectoria ha realizado dos estancias posdoctorales, la primera en la Facultad de Medicina de la UNAM, donde trabajó bajo la supervisión del Dr. Alejandro Fernández Velázquez y la segunda, gracias a la beca The Pew Latinoamerican Scholar, en la University of California, Davis, bajo la dirección de los Doctores Henning Stahlberg y James Evans. En ambas estancias tuvo énfasis el uso de herramientas computacionales para la determinación, estudio y rediseño de la estructura de proteínas, mismas herramientas que ahora aplica para establecer metodologías de predicción de interacciones de proteínas con ligados mediante acoplamiento simulado y el estudio de la función de proteínas mediante dinámica molecular.
Trabaja en el desarrollo de tres proyectos: la caracterización computacional y experimental de la beta-lactoglobulina de la leche de vaca, el impacto de la isomerización de cistrans prolina de la proteína periplasmica de Salmonella tiphy de unión a arginina, lisina y ornitina y el diseño de fármacos contra el virus de la influenza. Adicionalmente, se ha involucrado en el desarrollo de aplicaciones de realidad aumentada para la enseñanza de la bioquímica y otras materias.
En el área docente, fue profesor investigador titular de tiempo completo en la Universidad Autónoma Metropolitana y durante su estacia en la University of California Davis, fue encargado de guiar, estructurar y buscar financiamiento para proyectos de investigación científica. Actualmente, es profesor de tiempo completo en la Universidad de las Américas Puebla.
  

 
 

Producción de investigación

Sección 
 
Año




Formación de recursos humanos, tesis dirigidas

2019
Evaluacion del acoplamiento molecular en la proteina silvestre y mutantes de BLG de la leche de Bos taurus para la union de ligandos endogenos.

2019
Inhibicion de las enzimas alfa-glucosidasa mediante compuestos organicos extraidos de la herbolaria mexicana.

2019
Evaluación del acoplamiento molecular en la proteína silvestre y mutantes de LAO de la enterobacteria Salmonella entérica subsp. enterica serovar Typhimurium para la unión de ligandos no endógenos

2017
Determinación computacional de sitios de interacción proteína-ligando usando docking rígido, flexible por residuo y mecánica molecular.

2012
Estudio sobre la interacción entre la ß-Lactoglobulina y la ß-Galactosidasa de Kluyveromyces lactis y el Papel que Juegan los Aminoácidos de las Proteínas en la Interacción y el Efecto Activador sobre la Enzima



Congresos Nacionales

2017
Cortes-Hernandez, Paulina; Domninguez-Ramirez, Lenin Cis-Trans proline isomerization effect on the function of Periplasmic Binding Proteins Taller de Simulacion Molecular y Muestreo Acelerado

2017
Cortes-Hernandez, Paulina; Perez-Salvador, V; Ventura-Velasco, R; Ramirez-Ramirez, S; Maycotte-Gonzalez; Anaya-Ruis, M; Dominguez-Ramirez, Lenin The pharmacological modulation of the oestrogen related receptor alpha impacts mitochondrial dynamics in cancer cell lines Congreso de Bioenergetica y Biomembranas

2017
Dominguez-Ramirez, Lenin 1er Taller de Simulacion Computacional de Biomoleculas Docking y modelado de biomoleculas

2017
Cortes-Hernandez, Paulina, Dominguez-Ramirez, Lenin Role of cis-trans proline isomerization in the function of pathogenic enterobacterial Periplasmic Binding Proteins. 6to Congreso de Fisicoquimica, Estructura y Diseño de Proteinas

2014
Modelaje, docking y simulación: bioquímica de macromoléculas a nivel atómico

2013
Interacciones POPs-ADN, una análisis computacional con docking y dinámica molecular.

2013
The binding of lactose and biological ligands to ß-lactoglobulin at the calyx and the dimer interface: a theoretical study



Congresos Internacionales

2019
Microsecond simulations of bLg to determine how a single protein binds diverse ligands.

2014
Biologia Estructural



Artículos de investigación

2018
A novel progesterone receptor membrane component (PGRMC) in the human and swine parasite Taenia solium: implications to the host-parasite relationship

2018
Molecular dynamics simulations of the catalytic subunit of Calpains 1, 2, 5 and 10: structural analysis with an aim towards drug design

2017
Role of cis-trans proline isomerization in the function of pathogenic enterobacterial Periplasmic Binding Proteins

2015
Javier R Ambrosio, Laura Valverde-Islas, Karen E Nava-Castro, M Isabel Palacios-Arreola, Pedro Ostoa-Saloma, Olivia Reynoso-Ducoing, Galileo Escobedo, Azucena Ruíz-Rosado, Lenin Domínguez-Ramírez, and Jorge Morales-Montor, Androgens Exert a Cysticidal Effect upon Taenia crassiceps by Disrupting Flame Cell Morphology and Function. PLoS ONE

2015
Alia Méndez-Albores, Cristina Tarín, Georgette Rebollar-Pérez, Lenin Domínguez-Ramírez, and Eduardo Torres Biocatalytic spectrophotometric method to detect paracetamol in water samples. J Environ Sci Health A Tox Hazard Subst Environ Eng

2014
Dominique Bréchemier-Baey, Lenin Domínguez-Ramírez, Jacques Oberto, and Jacqueline Plumbridge, Operator recognition by the ROK transcription factor family members, NagC and Mlc. Nucleic Acids Research

2014
Gustavo De la Vega-Ruíz, Lenin Domínguez-Ramírez, Héctor Riveros-Rosas, Carlos Guerrero-Mendiola, Alfredo Torres-Larios, Gloria Hernandez-Alcantara, José J García-Trejo, and Leticia Ramírez-Sílva. New insights on the mechanism of the K(+-) independent activity of crenarchaeota pyruvate kinases. PlosONE

2013
ß-Lactoglobulins Conformational Requirements for Ligand Binding at the Calyx and the Dimer Interphase: a Flexible Docking Study Lenin Domínguez-Ramírez, Elizabeth Del Moral-Ramírez, Paulina Cortes-Hernández, Mariano García-Garibay, Judith Jiménez-Guzmán PLOS One

2013
Interactions of subunits Asa2, Asa4 and Asa7 in the peripheral stalk of the mitochondrial ATP synthase of the chlorophycean alga Polytomella sp. Héctor Miranda-Astudillo, Araceli Cano-Estrada, Miriam Vázquez-Acevedo, Lilia Colina-Tenorio, Angela Downie-Velasco, Pierre Cardol, Claire Remacle, Lenin Domínguez-Ramírez, Diego González-Halphen Biochimica et Biophysica Acta

2012
Effects of a Buried Cysteine-To-Serine Mutation on Yeast Triosephosphate Isomerase Structure and Stability International Journal of Molecular Sciences Alejandra Hernández-Santoyo, Lenin Domínguez-Ramírez, César A. Reyes-López, Edith González-Mondragón, Andrés Hernández-Arana and Adela Rodríguez-Romero

2012
The linker sequence, joining the DNA-binding domain of the homologous transcription factors, Mlc and NagC, to the rest of the protein, determines the specificity of their DNA target recognition in Escherichia coli Dominique Bréchemier-Baey, Lenin Domínguez-Ramírez and Jacqueline Plumbridge Molecular Microbiology



Libros Editorial Internacional

2018
Handbook of Environmental Chemistry

2016
Frontiers in Clinical Drug Research: Anti-Infectives Drug Safety Approaches in Anti-Infective Drug Discovery and Development

 
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