Ponentes - Biomédica

Alvaro_Rios-UDLAP

PONENCIA

“FUTURO DE LOS SISTEMAS BIÓNICOS Y CYBORGS”

Conferencias Simultáneas

Semblanza:

Álvaro Ríos Poveda, recibió grado en Ingeniería Electrónica en la Pontificia Universidad Javeriana, Maestría en Ingeniería Biomédica la Universidad Simón Bolívar, estudios de doctorado en Prótesis neurales (USF) y EMBA (ISEAD).
Se ha enfocado en la investigación y desarrollo de tecnologías asistivas para mejorar la calidad de vida de los discapacitados en los países en vías de desarrollo.
Desde el comienzo de su carrera como investigador se enfocó en el área de sistemas biónicos, prótesis mioeléctricas y prótesis neurales.
Ha sido líder por +20 años de empresas multinacionales de alta tecnología, manufactura y servicios de tecnología en salud. Se ha desempeñado en en varios cargos directivos en empresas como Siemens Medical AG, Draeger, Esaote Biomedica, IQ, etc.
Actualmente es CEO de Human Assistive Technologies. Miembro del capítulo GATE de la Organización Mundial de la Salud, miembro IEEE, Miembro fundador de la Asociación Colombiana de Ing Biomedica (ABIOIN), CHAIRMAN para América de Bionics and Cyborgs de la IEEE, Miembro del comité de publicaciones de la IFMBE y docente universitario en varios países.
Sus áreas de Interes: E-Health, AI, Assistive Technologies, Bionics.

Resumen:
Al observar un brazo biónico, podemos pensar que las articulaciones robóticas del brazo son los componentes principales de la tecnología. Sin embargo, es el sistema de control del usuario el que tiene la clave para restaurar las capacidades casi naturales de los sistemas biónicos.
El concepto general detrás de los sistemas de control biónicos es interceptar las señales del cerebro y convertirlas en comandos para el dispositivo biónico.
¿Cuáles son las tecnologías emergentes que hacen posible los sistemas de control más naturales? ¿Es posible fusionar el hombre y la robótica? ¿Cuál es el futuro de los cyborgs? Son parte de las inquietudes que resolveremos en esta conferencia.

Barbara_Gallardo-UDLAP

PONENCIA

“ESPIRÓMETRO DE TURBINA PARA TERAPIA RESPIRATORIA”

Conferencias Generales

Resumen:
El trabajo presentado a continuación es una tesis de diseño biomédico e instrumentación electrónica que utiliza conceptos anatómicos, fisiológicos, y de espirometría para comprender las necesidades médicas actuales del sistema de salud tal como la pandemia del COVID-19 y aplicar las competencias ingenieriles necesarias al desarrollar un instrumento biomédico. Esta propuesta surge por la necesidad actual de dispositivos para terapia respiratoria remota con el fin de desarrollar un dispositivo terapéutico efectivo el cual se pueda utilizar desde la comodidad del hogar sin exponerse en clínicas médicas saturadas.
En el documento se reporta el diseño mecánico, digital, instrumental, de transmisión y el método de despliegue de datos, de un espirómetro de turbina para la terapia respiratoria. El espirómetro es un dispositivo ampliamente utilizado para evaluar la mecánica respiratoria y así poder analizar, determinar, monitorear y brindar terapia a enfermedades pulmonares obstructivas crónicas (EPOC) o patologías relacionadas con el sistema respiratorio.
La terapia respiratoria es importante para la rehabilitación exitosa de enfermedades relacionadas con el sistema respiratorio como son la EPOC y el COVID-19. La numerosa cantidad de muertes registradas a nivel mundial por la pandemia y considerando que la EPOC es la cuarta causa de defunción en el mundo se considera que es indispensable la evaluación y terapia del sistema respiratorio. Para realizar esta terapia se necesitan aparatos espirométricos y médicos especialistas para interpretar las pruebas, obligando a los pacientes a desplazarse en cuestiones de salud precarias y realizar gastos notables.
El espirómetro de turbina diseñado es un dispositivo portátil y telemétrico que abre las puertas al paciente para realizar una terapia respiratoria efectiva con retroalimentación médica. En este trabajo se desarrolla un diseño mecánico en CATIA para la futura elaboración del prototipo físico. Por medio de la instrumentación digital y el sensado magnético se adquiere y procesa una señal de flujo espiratorio para después ser convertida en una medición de flujo máximo espirado por segundo. Los datos son procesados en un microcontrolador Arduino para después ser transmitidos por medio de bluetooth y visualizados a en una terminal virtual que representa un dispositivo móvil.

Birzabith_Mendoza-UDLAP

PONENCIA

“IMPLANTES DE COLÁGENO ESTRUCTURADOS: CURACIÓN DE HERIDAS CON ENFOQUE HACIA LA REGENERACIÓN”

Conferencias Generales

Resumen: 
Se presenta una introducción sobre estrategias basadas en biomateriales y enfocadas en el control del proceso curación de heridas para desencadenar una respuesta regenerativa por encima de una cicatrizal. Se presenta una propuesta desarrollada en el Laboratorio de Biomateriales de la Universidad de Guanajuato campus León que parte del aprovechamiento de un biopolímero ampliamente conocido y accesible. Así, se presentan los aspectos fisicoquímicos en el diseño de hidrogeles de colágeno estructurados con oligouretanos y sílice coloidal, su comportamiento reológico en vista de contar con un sistema 3D inyectable y acarreador de células, y la respuesta celular en experimentos in vitro, ex vivo e in vivo en búsqueda de promover una reconstrucción funcional y regenerativa en tejidos suaves. 

  • Profesor titular del Depto. de Ingenierías Química, Electrónica y Biomédica de la Universidad de Guanajuato, Campus León.  
  • Cuerpo Académico del grupo de investigación en Biomateriales.  
  • Es Ingeniero Químico por parte del Instituto Tecnológico de Campeche. 
  • Realizó su maestría en el Centro de Investigación Científica de Yucatán.  
  • Doctorado en la Universidad de Guanajuato.
Brenda_Rangel-UDLAP

PONENCIA

“SISTEMAS INTELIGENTES-RECONOCIMIENTO DE QUEMADURAS PARA SU DIAGNÓSTICO Y TRATAMIENTO”

Conferencias Generales

Abstract:

Burn injuries are the fourth leading cause of death among accidental deaths. These events only represent a small amount of the total cases since many of the burnt are not recorded
because they are not seen in hospitals.   Burns are dynamic, which means that they can progress with time.  These injuries can fully recover if they get a fast, and opportune treatment. 
Currently, the methods used in hospitals for diagnosis and establish a treatment are based on approximation tables and the experience of the physicians.  This can be problematic especially when the surgeons are not available.  We propose a model based on interactive machine learning to recognize burns and classify them as well as give a possible treatment. We use a technique based on sparse representation to segmentize the image and obtain a classification of the burnt area. Some challenges of this implementation are presented.

Semblanza:
Brenda Rangel Olvera es estudiante del doctorado en sistemas inteligentes en la Universidad de las Américas Puebla. Es ingeniera en mecatrónica por parte de la misma institución y se encuentra actualmente cursando su tercer año del doctorado. Su trabajo se enfoca en la detección y clasificación de quemaduras humanas con métodos de machine learning.

Carla_Mendez-UDLAP

PONENCIA

“MANUAL DE PRÁCTICAS PARA EL ULTRASONIDO WED-9618”

Conferencias Simultáneas

Resumen:

El laboratorio de Computación, Electrónica y Mecatrónica de la UDLAP cuenta con un sinfín de componentes y equipos, entre los que se encuentra un equipo de ultrasonido de imagen (Modelo WED 9618). Lamentablemente, el departamento no cuenta con la experiencia necesaria ni con un manual de prácticas para utilizarlo adecuadamente y, por ende, se ha limitado su uso tanto por profesores como por los alumnos.

Este proyecto está enfocado a la generación de un conjunto de experiencias de aprendizaje tanto de las funciones del ultrasonido, como en los procedimientos de uso más simples para la generación de imágenes ultrasónicas, que permitan aprender las técnicas básicas, así como identificar campos de oportunidad en el mejoramiento de la técnica.

Se desarrolló un manual de prácticas de ecografía que buscan enseñar al usuario las funciones básicas de la técnica, comenzando con prácticas sencillas sobre los controles y funciones del ultrasonido; y finalizando con prácticas que incluyen actividades para la correcta visualización del riñón derecho y de las venas suprahepáticas, así como el lóbulo derecho del hígado. De dichas prácticas se obtuvieron resultados formidables, pues la estructura observada es fácilmente visible en todos los casos.

Semblanza:

Graduada con honores de la Universidad de las Américas Puebla de la carrera de ingeniería biomédica en el 2020. Practicante en el Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN, unidad Monterrey, en el proyecto titulado Procesamiento de señales biomédicas, en el que se adquirieron y procesaron señales de electroencefalografía. También realizó prácticas en Ingeniería, Mantenimiento, Material y Equipo Médico Puebla haciendo mantenimiento preventivo de equipo médico y de laboratorio. Además, formó parte del Programa Honores, en el cual desarrolló la tesis titulada: Manual de prácticas para el ultrasonido WED-9618.

Cynthia_Baldelamar-UDLAP

PONENCIA

“DISEÑO Y PROGRAMACIÓN DE VIDEOJUEGO PARA REHABILITACIÓN DE ESGUINCE DE TOBILLO EN NIÑOS”

Conferencias Simultáneas

Resumen:

El esguince de tobillo es una de las lesiones más comunes del aparato locomotor, y su tratamiento se basa principalmente en una serie de terapias repetitivas que tienen como objetivo recuperar las habilidades físicas afectadas; sin embargo, estas podrían llegar a ser tediosas para un niño si no se hacen de manera dinámica y divertida.

La presente investigación tiene como objetivo proponer el diseño de un videojuego programado especialmente para rehabilitación de esguince de tobillo en niños, el cual logre entretener y motivar al paciente a través de retos atractivos al mismo tiempo que este se rehabilita.

Semblanza:

Egresada con honores de la licenciatura en Ingeniería Biomédica en la Universidad de las Américas Puebla. Acreedora de la beca Emerging Leaders in the Americas Program, con la que tuvo la oportunidad de realizar una estancia de investigación en la Universidad de Victoria, Canadá, en un laboratorio de ingeniería de tejidos y bioimpresión en 3D. Asimismo, realizó una estancia corta de investigación en el Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN, campus Monterrey, en el laboratorio de Biomicrofluids Applied Research, Technology and Science Laboratory.

Francisco_Valencia-UDLAP

PONENCIA

“EXPERIENCIA EN EL DISEÑO Y DESARROLLO DE DISPOSITIVOS MÉDICOS USANDO TECNOLOGÍAS DE IMPRESIÓN Y ESCANEO 3D”

Conferencias Generales

Semblanza:

Francisco es ingeniero en mecatrónica por el Tecnológico de Monterrey. Ha trabajado como investigador forense digital y consultor en ciberseguridad. Cofundó ZapopanLab, un laboratorio de innovación cívica y datos abiertos reconocido por el Banco Mundial por su trabajo en resolución de problemáticas públicas del gobierno. Fue reconocido por MIT como innovador de LATAM menor de 35 años y ha representado a México en el extranjero en competencias de emprendimiento y negocios en dos ocasiones. El Banco Interamericano de Desarrollo ha publicado estudios sobre su empresa, Prothesia. Y esta ha sido galardonada con la mayor presea del Tec de MTY: el premio Eugenio Garza Sada en la categoría de impacto social.

Prothesia fabrica software para la creación de dispositivos médicos a la medida cómo prótesis y órtesis. Debido a la pandemia adaptaron su negocio a impresión 3D de mascarillas, válvulas e hisopos - Han ayudado a que más de 15,000 mexicanos se hagan prueba PCR, salvando potencialmente la vida de hasta 45,000 personas debido a los pacientes asintomáticos que podrían portar el virus. En sus ratos libres le gusta hacer senderismo, correr, jugar ajedrez, y la fotografía.

Karla_Paniagua-UDLAP

PONENCIA

“MODELADO E IMPRESIÓN 3D DE UNA VÉRTEBRA CERVICAL (C7)”

Conferencias Generales

La Ing. Karla Daniela es egresada con honores de la licenciatura de Ingeniería Biomédica de la Universidad de las Américas Puebla. En donde tuvo la oportunidad de trabajar junto al Dr. Rubén Alejos en proyectos de investigación y realizó una estancia como estudiante de Investigación en la Universitat de Valencia España. Actualmente se encuentra estudiando el primer año de Ph.D en Ingeniería Eléctrica en University of Texas at San Antonio. En donde está participando en diferentes proyectos de investigación en los temas de Single-cell y Genómica. Su campo de investigación está enfocado en Bioinformática.

Resumen de Ponencia:

 El presente proyecto tuvo como objetivo desarrollar un modelo parametrizado de vértebra cervical C7 a partir de una vértebra cervical humana, que pueda servir para generar una prótesis cervical que mejore la calidad de vida del paciente después de una lesión o patología que requiera sustitución cervical, que sea más accesible y cuyas características puedan ser modificadas de acuerdo a las necesidades de éste. Para iniciar el proyecto, se digitalizó una vértebra cervical humana, la cual fue utilizada como base junto con el programa Openscad, para generar un modelo. Las trayectorias de dicho modelo fueron analizadas y posteriormente seccionadas por herramientas de software para la obtención de las ecuaciones polinomiales de cada una de ellas que permitiera la parametrización de dicho modelo.

Los resultados obtenidos, incluyen un modelo parametrizado de la vértebra cervical C7, en donde se comprueba la validez de la hipótesis principal, la cual establece, que se puede generar un modelo basado en una vértebra digitalizada a partir de un prisma rectangular que será maquinado con herramientas de corte cilíndricas siguiendo las trayectorias obtenidas. Todo lo anterior con el propósito de lograr el objetivo principal de construir un modelo matemático que permita dimensionar dicho modelo para poder ser escalado cuando pacientes de diferentes edades y estaturas requieran su uso. Ésta última es, una propuesta para el trabajo futuro de esta investigación.

Luis_Bravo-UDLAP

PONENCIA

“EXTREMIDADES BIÓNICAS UNA REALIDAD EN MÉXICO POR PROBIONICS”

Conferencias Simultáneas

Semblanza:

Ingeniero en Biónica egresado del Instituto Politécnico Nacional.  

Fundador y Director General de la empresa “PROBIONICS, S.A. DE C.V.” dedicada al desarrollo de sistemas de ingeniería para el área de rehabilitación.  

Reconocido como el Innovador del año por la Academia Mexicana de Ciencias Académicas y Sociales en el año 2005.  

Ganador del “PREMIO CANIETI 2006” a la innovación tecnológica.

Ganador del “PREMIO ESTATAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA 2007” en el Estado de México.

Ganador del “PREMIO ADIAT 2008”.  

Ganador del “PREMIO ESTATAL A LA EXCELENCIA EMPRESARIAL MEXIQUENSE 2008”

Invitado como líder tecnológico en el año 2009 al “International Workshop on Technological Innovations” celebrado en Beijing China.  

Ganador del PREMIO INTERNACIONAL TECNOS 2009 en la categoría de innovación tecnológica

Distinguido con el reconocimiento Quo Discovery 2012 y como Embajador Mente Futuro Quo Discovery 2012.  

Nombrado Líder del Futuro y miembro del Club Líderes del Futuro por la Revista Líderes Mexicanos 2013

Asesor tecnológico en materia ortopédica para CFE a nivel Nacional 2014

Distinguido como uno de los líderes más destacados en materia de tecnología de vanguardia por la Revista Newsweek 2014

Ganador del “PREMIO NACIONAL DE INNOVACIÓN TECNOLÓGICA PARA LA INCLUSIÓN SOCIAL INNOVATIS 2017”

Miembro consejero en Tecnología de la Sociedad Mexicana de Cirugía de Mano A. C.  

Líder del desarrollo de la primera prótesis electrónica no invasiva para amputaciones de miembro superior en México, beneficiando a más de 230 personas con esta tecnología, impartiendo hasta el momento más de 190 conferencias a nivel nacional e internacional sobre este desarrollo.

Marco_Mendoza-UDLAP

PONENCIA

“ROBÓTICA Y CONTROL EN SISTEMAS DE REHABILITACIÓN Y ASISTENCIA”

Conferencias Simultáneas

Semblanza:

Recibió el grado de Ingeniero en Comunicaciones y Electrónica (2003) de la Universidad de Colima, el grado de Maestro en Ciencias de la Electrónica opción Automatización (2006) de la Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, y el grado de Doctor en Ingeniería Eléctrica opción Control Automático (2011) de la Universidad Autónoma de San Luis Potosí.

Entre 2011 y 2012 fue profesor de tiempo completo del Departamento de Investigación en Física de la Universidad de Sonora. Realizó una estancia postdoctoral en 2013 en la División de Control y Sistemas Dinámicos del Instituto Potosino de Investigación Científica y Tecnológica, A.C. (IPICYT). Desde 2014 trabaja como profesor de tiempo completo en la Facultad de Ciencias de la Universidad Autónoma de San Luis Potosí, donde en el periodo 2016-2019 fue coordinador de la licenciatura en Ingeniería Biomédica.

Sus principales líneas de investigación son: Robótica y Sistemas de Manufactura; Control, Diagnóstico y Monitoreo de Procesos; Sistemas Médicos y del Cuidado de la Salud. Dentro de estas líneas ha dirigido y concluido: 2 proyectos de tesis de doctorado, 4 tesis de maestría y 10 tesis de licenciatura. Los resultados más relevantes de estos proyectos han sido publicados en más de 15 artículos en revistas indexadas (JCR), 3 capítulos de libro y 40 artículos en memorias de congresos nacionales e internacionales.

Actualmente, es miembro del Sistema Nacional de Investigadores Nivel I y cuenta con el reconocimiento de Perfil Deseable del Programa para el Desarrollo Profesional Docente para el Tipo Superior (PRODEP).

Mario_Flores-UDLAP

PONENCIA

“ANÁLISIS UNICELULAR DE SEÑALES DE EXPRESIÓN GÉNETICA DE PACIENTES CON COVID-19 QUE PRESENTAN DIFERENTES NIVELES DE GRAVEDAD”

Conferencias Simultáneas

Areas of Teaching Interest

Computational Biology
Digital Signal Processing
Mathematical Foundations of Machine Learning

Areas of Research Interest

Computational Biology
Single-Cell Analysis
Omics Analysis
Deep Learning

Educational Background

Research Fellow, National Center of Biotechnology Information at National Institutes of Health, Bethesda, Maryland
PhD. University of Texas at San Antonio
MS. University of Texas at San Antonio
BS. Universidad Autonoma Metropolitana, Mexico City


Description of Research

My present research focus in the computational biology study of virus-cells interactions. For this we utilize single-cell and bulk technologies, Deep Learning algorithms. comparative genomics, Bayesian statistics, multiple sequence alignments, libraries of transcription factor binding sites, sequence pattern recognition techniques, dynamic programming, population genetics, and transgenic animal experimentation (the latter through collaborations). Our research relies on collaborative studies with several research and clinical groups within UTSA and from other research Universities and Institutions.

Selected Publications
Zhang, T.H., Flores, M. and Huang, Y. (2021) ES-ARCNN: Predicting enhancer strength by using data augmentation and residual convolutional neural network. Anal Biochem, 618,

Flores, Mario; Ovcharenko, Ivan, Enhancer Reprogramming in mammalian genomes. BMC Bioinformatics, 2018, Volume 19, Number 1. (Impact Factor:2.51)

Ma, C., Sastry, K.S., Flores, M., Gehani, S., Al-Bozom, I., Feng, Y., Serpedin, E., Chouchane, L.,Chen, Y. and Huang, Y. (2016) CrossLink: a novel method for cross-condition classification of cancer subtypes. BMC Genomics . (Impact Factor:3.5)

Liu Hui; Flores, Mario; Meng, Jia; Zhang, Lin; Zhao, Xinyu; Rao, Manjeet; Chen, Yidong; Huang, Yufei, MeT-DB: A database of transcriptome methylation in mammalian cells. Nucleic Acids Research 2014 Nov 6, pii:gku1024 (First three authors should be regarded as Joint First Authors.) (Impact Factor:8.81)

M. Flores, Y. Chen, Y. Huang. TraceRNA: A Web Application for Competing Endogenous RNA Exploration. Circ Cardiovasc. Genet, 2014, Aug; 7(4): 548-57. doi: 10.1161/CIRCGENETICS.113.000125(Impact Factor:6.73)

Ma, Chifeng, Hung-I. H. Chen, Mario Flores, Yufei Huang, and Yidong Chen. “BRCA-Monet: a breast cancer specific drug treatment mode-of-action network for treatment effective prediction using large scale microarray database.” BMC Systems Biology 7, no. Suppl 5 (2013): S5. (Impact Factor:2.98)

M. Flores, T-H Hsiao, Y-C Chiu, E. Y. Chuang, Y. Huang, Y. Chen, “Gene Regulation, Modulation and Their Applications in Gene Expression Data Analysis,” Advances in Bioinformatics, 2013: 360678, 2013 March 13. doi: 10.1155/2013/360678, PMID:23573084

 M. Flores, Y. Huang, Y. Chen, “NETCERNA: an algorithm for construction of phenotype-specific regulation networks via competing endogenous RNAs,” 2013 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics (GENSIPS 2013), Houston, TX, Dec, 2013

Flores, M.; Yufei Huang, “A new algorithm for predicting competing endogenous rnas,” Genomic Signal Processing and Statistics, (GENSIPS), 2012 IEEE International Workshop on, vol., no., pp.118,121, 2-4 Dec. 2012 doi: 10.1109/GENSIPS.2012.6507743″

Martin_Duran-UDLAP

PONENCIA

“ANÁLISIS DE SEÑALES CEREBRALES RELACIONADAS A PERTURBACIONES EXTERNAS EN LAS EXTREMIDADES SUPERIORES”

Conferencias Generales

Semblanza:

Experiencia en Investigación y Desarrollo de Sistemas Inteligentes:
Desarrollo de un sistema de identificación de sordera en los bebés recién nacidos a partir del análisis de su llanto. Extracción de características lineales (modelo ARMA) y cuadráticas (kernel cuadrático). Desarrollo de sistemas de clasificación lineal (Adaboost) y probabilísticos (Máxima Expectación de Modelos de Mezcla de Gaussianas).

Publicaciones en Congresos:

Experiencia internacional sobre la seguridad en el transporte urbano. Titular de una beca en Francia por un año como Intercambio Académico en la Maestría de Riesgos Industriales, opción Transporte, Producción y Robótica (INSA Cèntre Val de Loire).

Trayectoria Profesional:
(2019-Actual)
Candidato a Dr. en Sistemas Inteligentes
Universidad de las Américas Puebla.
Proyecto de Tesis: Modelado no lineal de la actividad cerebral relacionada a tareas motrices

(2016-2018)
Maestría en Ciencias de la Electrónica, opción en Automatización
Benemérita Universidad Autónoma de Puebla

(2009-2015):
Ingeniería Mecatrónica
Benemérita Universidad Autónoma de Puebla

Nathalie-Vilchis-UDLAP

PONENCIA

“ROVERS DE MARTE”

Conferencias Generales

Semblanza:

Estudiante de ingeniería mecatrónica en el Tecnológico de Monterrey.

Nathalie es una estudiante que busca continuamente enfocar su carrera hacia el espacio, ha sido dos veces a ganadora de 1er lugar en el International Air and Space Program en Johnson Space Center de la NASA.

Durante su carrera ha realizado investigación en el área aeroespacial en conjunto con su universidad y la universidad metropolitana de Tokio.

Recientemente fue seleccionada para realizar una estancia de investigación en Jet Propulsion Laboratory de la NASA en Pasadena California. Por lo que creo el proyecto "Chica NASA" para buscar fondear su manutención durante la estancia.

Patricio_Zapata-UDLAP

PONENCIA

“BIOINFORMÁTICA: BASES DE DATOS ÓMICAS”

Conferencias Simultáneas

Semblanza:

  • Facultad de Ciencias Biológicas UANL
  • Maestría en Genómica estructural
  • Maestría en Genómica comparativa
  • Maestría en Secuenciación y anotación de genomas
  • Investigador CINVESTAV

Resumen:

El desarrollo de las tecnologías digitales ha provisto de avances en diversas disciplinas, desde predicciones de comportamiento de mercado hasta administración de recursos públicos. La previsión de estas herramientas asegura un progreso tangible en cualquier área que las adopte, por lo cual se denota que el área biológica ha sido lenta en su aprovechamiento, a pesar de tener los recursos de información necesarios para su uso.

El problema para obtener información aplicable a rubros específicos del área biológica radica principalmente en la cantidad de información existente, aunado a la falta de personal con el conocimiento para comprenderla, dosificarla, manejarla y transformarla. Actualmente, la capacidad de centros especializados en el almacenamiento de información digital permite amasar cantidades exorbitantes de datos de manera ordenada en repositorios denominados como bases de datos. Ejemplificando lo anterior podemos presentar el siguiente caso, Facebook en 2007 generaba 15TB de datos al día, en 2010 cerca de 700TB, actualmente son aproximadamente 4PB diarios (Desjardins, 2019), esto es un reflejo del crecimiento exponencial de la información como tal. Hablando en particular de las ciencias biológicas en años recientes (2010 - 2020) gracias a la existencia y constante mejora de las tecnologías de secuenciación de nueva generación (NGS), se genera actualmente más de 10Eb de información de índole ómico, la cual es depositada en base de datos especializadas tal como el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI).

La cantidad de información que es recabada, tanto de bases de datos bioinformáticas como de artículos científicos crece exponencialmente cada año, se teoriza que para el 2025 la cantidad de información proveniente de este rubro puede llegar a crecer hasta el orden de los zettabytes (1x1021 bytes) (Zachary, 2015). El NCBI provee recursos en línea de datos biológicos; dos de los sitios mayormente concurridos por la comunidad científica son las subdivisiones o bases de datos de secuencias de ácidos nucleicos y proteínas “GenBank” y la de “PubMed”, en esta última se encuentra el mayor número de artículos citados y publicados de diversas revistas renombradas. NCBI no se limita únicamente a las bases anteriormente mencionadas, sino que también recaba información que se clasifica en las categorías de literatura, salud, genomas, transcriptomas, metabolomas e interactomas. En la actualidad, GenBank posee más de 409,361,023 registros solo con secuencias de DNA y RNA (Sayers et al., 2020).

Desde su adjudicación del término en 1997, los procesos tecnológicos del “big data” confieren a los investigadores la tarea de ordenar la información de tal manera que se puedan evaluar sus propiedades. Esto concede que las áreas en las que emplea este tipo de herramientas prosperen al realizar inferencias y predicciones que antes no era posible visualizar. Los análisis del “big data” de salud se han favorecido substancialmente en los últimos 20 años por los avances tecnológicos en el área de las disciplinas ómicas. Las bondades que este tipo de bases de datos presenta reside en la amplia variedad existente, las cuales se pueden explotar con un poco de conocimiento del área, con la finalidad de generar posibles rutinas automatizadas en base a algoritmos de machine learning, para así generar valiosísimas herramientas predictivas en relación a diversos temas de interés en la biología.

Ramon_Farre-UDLAP

PONENCIA

“VENTILADORES MECÁNICOS DE BAJO COSTO EN DISEÑO ABIERTO PARA PAÍSES EN DESARROLLO O EMERGENCIA PANDÉMICA”

Conferencias Generales

Semblanza:

Ramón Farré (RF) is Professor of Physiology at the Biophysics and Bioengineering Unit of the Faculty of Medicine and Health Sciences of the University of Barcelona (UB) since 2003. In the area of teaching, he is carrying out responsibilities of coordination in the Degree of Medicine and in the Master of Bioengineering. Since 2019 he is Director of Education of the Degree of Biomedical Engineering of the University of Barcelona. In the area of university management, RF has been Secretary of the Department of Physiological Sciences I, Secretary and Vice-Dean of the Faculty of Medicine and member of the Delegate Economic Commission of the Governing Council of the UB.

In the area of national scientific management, RF is Coordinator of the Area "Biopathology and Respiratory, Cardiovascular and Renal Bioengineering" of the Institute of Biomedical Research of Augus Pi i Sunyer (IDIBAPS), is head of the research group "Respiratory biophysics and bioengineering" of the IDIBAPS, and head of Group 12 of the CIBER of Respiratory Diseases.

At the international level, in the last 12 years RF has been officer of the "Clinical Respiratory Physiology, Exercise and Functional Imaging" Assembly of the European Respiratory Society, and is a member of the strategic planning of the "Sleep and Respiratory Neurobiology" Assembly of the American Thoracic Society. Since 2008 he is Associate Editor of the European Respiratory Journal (1st decile ISI). Since the creation of EIT-Health (2015) until 2018, RF was Director of Education of its Spanish node and until 2019 has been a member of the "Strategic Committee of Education" of EIT-Health (Munich, Germany).

RF research is aimed at deepening our understanding of the mechanical behavior of the tissues, particularly to improve the diagnosis and treatment of respiratory diseases. To do this, RF uses a translational approach in a multidisciplinary framework that implies close cooperation with clinical respiratory research groups. RF studies biomechanics with a multiscale perspective that extends from the organ to the molecule. At the organ level, it studies the mechanical properties of the respiratory tract and pulmonary tissues and the alterations of the mechanical function associated with respiratory diseases, with particular focus on sleep apnea. At the cellular level, RF focuses its research on analyzing how the biomechanics of the cellular microenvironment, which is modified considerably in respiratory diseases, modulates the structure of the cytoskeleton and its mechanical function, the mechanics of the extracellular matrix and the consequent modifications of the mechanical interaction cell-matrix in respiratory diseases.

For these studies, RF uses advanced biophysical technologies such as Atomic Force Microscopy and Traction Microscopy. In addition to academic and research activities RF focus on translation of technological advances to medicine. To this end, in the las 10 years he has been leading contracts between the University of Barcelona and different companies of respiratory medical devices to design and evaluate improved settings. His h-index = 59, with >13,500 citations (Google Scholar).: Publications (PubMed). Website: http://www.ub.edu/biofisica/farre.htm