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JULIO LENIN DOMÍNGUEZ  RAMÍREZJULIO LENIN DOMÍNGUEZ  RAMÍREZ
JULIO LENIN DOMÍNGUEZ RAMÍREZ

Grados Académicos:

Doctorado en Ciencias Bioquímicas, Universidad Nacional Autonoma de Mexico.
Licenciado en Investigación Biomédica Básica, Universidad Nacional Autonoma de Mexico.


MIEMBRO DEL SISTEMA NACIONAL DE INVESTIGADORES (SNI) Nivel 1

Su interés en las ciencias se remonta a el premio Nobel de Química de 1997, otorgado a Paul D. Boyer, John E. Walker, Jens C. Skou. En particular, John Walker lo obtuvo por su trabajo determinando la estructura de una enzima mitocondrial, la ATP sintasa, Lenin Domínguez cursaba su segundo año en la carrera de Investigación Biomédica Básica en el Instituto de Investigaciones Biomédicas de la Universidad Nacional Autónoma de México. En ese periodo se observó un cambio del énfasis de la investigación científica de lo químico de la bioquímica a un a visión estructural. Para su tesis de Licenciatura, él trabajo con los Doctores Armando y Marietta Tuena de Gómez Puyou caracterizando bioquimicamente la ATP sintasa y su proteína inhibidora endógena. Para su doctorado, realizado en el Instituto de Fisiología Celular, en la UNAM, caracterizando las interacciones finas de la ATP cintas y su proteína inhibidora mediante biofísica y modelado computacional. Durante este periodo publico como autor y coautor 6 artículos científicos. Realizó dos estancias postdoctorales, una en la Facultad de Medicina de la UNAM y otra en la Universidad de California en Davis, USA. En la Facultad de Medicina, trabajo modificando la intercara de la triosafosfato isomerasa de levadura para incrementar su estabilidada. Trabajo bajo la supervisión del Dr. Alejandro Fernandez Velazquez. En la Universidad de California en Davis, trabajo en la determinación de la estructura de proteínas de membrana usando difracción de rayos X y microscopia electrónica. Trabajo bajo la supervisión de los Doctores Henning Stahlberg y James Evans. Ambas estancias tuvieron un énfasis en el uso de herramientas computacionales para la determinación, estudio y rediseño de la estructura de proteínas. Desde su regreso a México, Dr Lenin Domínguez ha dedicado su tiempo a establecer metodologías de predicción de interacciones de proteínas con ligados mediante acoplamiento simulado (docking) y el estudio de la función de proteínas mediante dinámica molecular.
  

 
 

Producción de investigación

Sección 
 
Año




Formación de recursos humanos, tesis dirigidas

2017
Determinación computacional de sitios de interacción proteína-ligando usando docking rígido, flexible por residuo y mecánica molecular.

2012
Estudio sobre la interacción entre la ß-Lactoglobulina y la ß-Galactosidasa de Kluyveromyces lactis y el Papel que Juegan los Aminoácidos de las Proteínas en la Interacción y el Efecto Activador sobre la Enzima



Congresos Nacionales

2017
Cortes-Hernandez, Paulina; Domninguez-Ramirez, Lenin Cis-Trans proline isomerization effect on the function of Periplasmic Binding Proteins Taller de Simulacion Molecular y Muestreo Acelerado

2017
Cortes-Hernandez, Paulina; Perez-Salvador, V; Ventura-Velasco, R; Ramirez-Ramirez, S; Maycotte-Gonzalez; Anaya-Ruis, M; Dominguez-Ramirez, Lenin The pharmacological modulation of the oestrogen related receptor alpha impacts mitochondrial dynamics in cancer cell lines Congreso de Bioenergetica y Biomembranas

2017
Dominguez-Ramirez, Lenin 1er Taller de Simulacion Computacional de Biomoleculas Docking y modelado de biomoleculas

2017
Cortes-Hernandez, Paulina, Dominguez-Ramirez, Lenin Role of cis-trans proline isomerization in the function of pathogenic enterobacterial Periplasmic Binding Proteins. 6to Congreso de Fisicoquimica, Estructura y Diseño de Proteinas

2014
Modelaje, docking y simulación: bioquímica de macromoléculas a nivel atómico

2013
Interacciones POPs-ADN, una análisis computacional con docking y dinámica molecular.

2013
The binding of lactose and biological ligands to ß-lactoglobulin at the calyx and the dimer interface: a theoretical study



Congresos Internacionales

2014
Biologia Estructural



Artículos de investigación

2015
Javier R Ambrosio, Laura Valverde-Islas, Karen E Nava-Castro, M Isabel Palacios-Arreola, Pedro Ostoa-Saloma, Olivia Reynoso-Ducoing, Galileo Escobedo, Azucena Ruíz-Rosado, Lenin Domínguez-Ramírez, and Jorge Morales-Montor, Androgens Exert a Cysticidal Effect upon Taenia crassiceps by Disrupting Flame Cell Morphology and Function. PLoS ONE

2015
Alia Méndez-Albores, Cristina Tarín, Georgette Rebollar-Pérez, Lenin Domínguez-Ramírez, and Eduardo Torres Biocatalytic spectrophotometric method to detect paracetamol in water samples. J Environ Sci Health A Tox Hazard Subst Environ Eng

2014
Dominique Bréchemier-Baey, Lenin Domínguez-Ramírez, Jacques Oberto, and Jacqueline Plumbridge, Operator recognition by the ROK transcription factor family members, NagC and Mlc. Nucleic Acids Research

2014
Gustavo De la Vega-Ruíz, Lenin Domínguez-Ramírez, Héctor Riveros-Rosas, Carlos Guerrero-Mendiola, Alfredo Torres-Larios, Gloria Hernandez-Alcantara, José J García-Trejo, and Leticia Ramírez-Sílva. New insights on the mechanism of the K(+-) independent activity of crenarchaeota pyruvate kinases. PlosONE

2014
Alia Méndez-Albores, Cristina Tarín, Georgette Rebollar, Lenin Dominguez, Eduardo Torres. Biocatalytic spectrophotometric method to detect paracetamol in water samples. Journal of environmental science and health, part A (2014) 0, 1-12.

2013
ß-Lactoglobulins Conformational Requirements for Ligand Binding at the Calyx and the Dimer Interphase: a Flexible Docking Study Lenin Domínguez-Ramírez, Elizabeth Del Moral-Ramírez, Paulina Cortes-Hernández, Mariano García-Garibay, Judith Jiménez-Guzmán PLOS One

2013
Interactions of subunits Asa2, Asa4 and Asa7 in the peripheral stalk of the mitochondrial ATP synthase of the chlorophycean alga Polytomella sp. Héctor Miranda-Astudillo, Araceli Cano-Estrada, Miriam Vázquez-Acevedo, Lilia Colina-Tenorio, Angela Downie-Velasco, Pierre Cardol, Claire Remacle, Lenin Domínguez-Ramírez, Diego González-Halphen Biochimica et Biophysica Acta

2012
Effects of a Buried Cysteine-To-Serine Mutation on Yeast Triosephosphate Isomerase Structure and Stability International Journal of Molecular Sciences Alejandra Hernández-Santoyo, Lenin Domínguez-Ramírez, César A. Reyes-López, Edith González-Mondragón, Andrés Hernández-Arana and Adela Rodríguez-Romero

2012
The linker sequence, joining the DNA-binding domain of the homologous transcription factors, Mlc and NagC, to the rest of the protein, determines the specificity of their DNA target ?recognition in Escherichia coli Dominique Bréchemier-Baey, Lenin Domínguez-Ramírez and Jacqueline Plumbridge Molecular Microbiology

2
Javier R. Ambrosio, Laura Valverde-Islas, Karen E. Nava-Castro, M. Isabel Palacios- Arreola, Pedro Ostoa-Saloma, Olivia Reynoso-Ducoing, Galileo Escobedo, Azucena Ruíz-Rosado, Lenin Dominguez-Ramírez, and Jorge Morales-Montor. Androgens exert a cysticidal effect upon Taenia crassiceps by disrupting flame cell morphology and function

1
Lenin Domínguez-Ramírez, Roberto Jareth Vázquez-Nuñez, Paulina Cortes-Hernandez. Docking prediction and molecular dynamics quantification of pesticide binding to a major protein component of cow milk. Sometido a publicación a Biophysical Journal.

 
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